Hi all,<br /><br />I am trying to obtain proper dihedral parameters for&nbsp;
CA-CT-CT-CA&nbsp; type, which is not in the OPLS-AA database. I have found a
set for periodic dihedral type (from AMBER database) but I dont know how to
convert that into RB form. GMX Manual does not mention how to convert periodic
proper terms into RB form. <br /><p>
So, my questions are:</p><p>1) Can I put periodic dihedral parameters into
OPLS-AA database?</p><p>2) If (1) is no, then how can I convert periodic type
into RB form? Is there any specific point to consider when using AMBER terms?
(e.g. multiplying coefficients by 2)<br /></p><p>3) 
Does anyone readily have the CA-CT-CT-CA dihedral parameters
:)</p><p>&nbsp;</p><p>Thanks in advance,</p><p>Murat CETINKAYA<br />The
Pennsylvania State University<br /><br />
</p>