hi everybody, <br>
i am working on melenin binding complex while trying to run my
simulation i had been getting some problems with the ligand portion.so
what i did is i had run prodrg for hetatoms BCT and 3ID and for FE i
used pdb2gmx. and i merged all the gro files obtained and for the
topology files i did some alterations like i gave statements like<br>
&nbsp; Include forcefield parameters<br>
#include &quot;ffG43a1.itp&quot;<br>
#include &quot;FE.itp&quot;<br>
#include &quot;BCT.itp&quot;<br>
#include &quot;3ID.itp&quot;<br>
#include &quot;HOH.itp&quot;<br>
<br>
[ moleculetype ]<br>
; Name&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; nrexcl<br>
Protein_A&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 3<br>
FE&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 2<br>
BCT&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 4<br>
3ID&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 15<br>
HOH&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 216<br>
&nbsp;but now when i tried to run the grompp step i get an fatal error<br>
Invalid order for directive position_restraints, file &quot;&quot;FE.itp&quot;&quot;, line 6<br>
any suggestions would be appreciated.<br>