<div>Hi Amanda ,</div>  <div>&nbsp;</div>  <div>I got the same error with you.I have tried to calculate a protein structure which has two chains.This chains are bound with eachother with disulphide bonds.I used -merge -ignh -ss in pdb2gmx.Have you solved your problem .This the error message:</div>  <div>&nbsp;</div>  <div>Error on node 4, will try to stop all the nodes<BR>Halting parallel program mdrun_mpi on CPU 4 out of 8<BR>-------------------------------------------------------<BR>Program mdrun, VERSION 3.3<BR>Source code file: nsgrid.c, line: 220<BR>Fatal error:<BR>Number of grid cells is zero. Probably the system and box collapsed.<BR></div>  <div>&nbsp;</div>  <div>If you got some decision about this problem,please help me.I looked up all the message in the list,but Icouldn't find.</div>  <div>&nbsp;</div>  <div>Thank U</div><p>&#32;

      <hr size=1>Ahhh...imagining that irresistible "new car" smell?<br> Check out
<a href="http://us.rd.yahoo.com/evt=48245/*http://autos.yahoo.com/new_cars.html;_ylc=X3oDMTE1YW1jcXJ2BF9TAzk3MTA3MDc2BHNlYwNtYWlsdGFncwRzbGsDbmV3LWNhcnM-">new cars at Yahoo! Autos.</a>