
<HTML><BODY style="word-wrap: break-word; -khtml-nbsp-mode: space; -khtml-line-break: after-white-space; ">Hi,<DIV><BR><DIV><DIV>On May 3, 2007, at 12:37 PM, Jones de Andrade wrote:</DIV><BR class="Apple-interchange-newline"><BLOCKQUOTE type="cite">Hi Berk! Thanks for your so fast answer!<BR><BR>I'll try to look for a different tau_p. I would really feel 4 ps a too high value, even for water systems, but will look around before decision. Anyway, I'm still concerned about the compressibility value. <BR><BR>Long time ago in this list I came to this question, and this is how this ended:<BR><BR><PRE><I></I>><I> Hi,<BR></I>><I><BR></I>><I> Just use the water value for any liquid system (5e-5 or so).<BR></I>>

<I><BR></I>><I> As the manual explains, it only affects the coupling time, not the<BR></I>><I> equilibrium pressure.<BR></I>></PRE></BLOCKQUOTE><DIV><BR class="khtml-block-placeholder"></DIV>This is valid for long times, and (as always for pressure) assumes the external coupling to be clearly slower than the internal dynamics. I have no idea how Amber or DLPOLY sets their tau_t with Nose or Parinello-Rahman, but as specified in the Gromacs manual we use the period of average fluctuations at equilibrium. With tau=0.1 the system will very likely never reach that equilibrium.</DIV><DIV><BR class="khtml-block-placeholder"></DIV><DIV>Cheers,</DIV><DIV><BR class="khtml-block-placeholder"></DIV><DIV>Erik</DIV><DIV><BR class="khtml-block-placeholder"></DIV></DIV></BODY></HTML>