<DIV class=MsoNormal style="MARGIN: 0in 0in 0pt"><FONT face="Times New Roman" size=3>Dear gmx users,</FONT></DIV>  <DIV class=MsoNormal style="MARGIN: 0in 0in 0pt"><FONT size=3><FONT face="Times New Roman"><SPAN>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; </SPAN>I have one doubt regarding conversion of C6/C12 parameters to sigma /epsilon. </FONT></FONT><FONT size=3><FONT face="Times New Roman">As Mr C<SPAN>hris neale said (</SPAN></FONT></FONT><A href="http://www.gromacs.org/pipermail/gmx-users/2006-May/021416.html" target=_blank rel=nofollow><FONT face="Times New Roman" color=#800080 size=3>http://www.gromacs.org/pipermail/gmx-users/2006-May/021416.html</FONT></A><FONT face="Times New Roman" size=3> <SPAN>), <SPAN>&nbsp;</SPAN>I</SPAN> added atomtypes, pairtypes and dihedraltypes from lipid.itp to ffoplsaanb.itp---after
 changing C6/C12 paramters to sigma/epsilon. </FONT></DIV>  <DIV class=MsoNormal style="MARGIN: 0in 0in 0pt"><FONT face="Times New Roman" size=3></FONT>&nbsp;</DIV>  <DIV class=MsoNormal style="MARGIN: 0in 0in 0pt"><FONT face="Times New Roman" size=3>My questions are</FONT></DIV>  <DIV class=MsoNormal style="MARGIN: 0in 0in 0pt"><FONT face="Times New Roman" size=3>(1) Is it also required to do conversion of C6/C12 parameters of “nonbond_params“to sigma/epsilon and adding these parameters from lipid.itp to ffoplsaanb.itp.</FONT></DIV>  <DIV class=MsoNormal style="MARGIN: 0in 0in 0pt"><FONT face="Times New Roman" size=3></FONT>&nbsp;</DIV>  <DIV class=MsoNormal style="MARGIN: 0in 0in 0pt"><FONT size=3><FONT face="Times New Roman">(2) If it is not required to convert” nonbond_params” parameters, is it required to call these parameters without conversion.</FONT></FONT></DIV>  <DIV class=MsoNormal style="MARGIN: 0in 0in 0pt"><FONT face="Times New Roman"
 size=3></FONT>&nbsp;</DIV>  <DIV class=MsoNormal style="MARGIN: 0in 0in 0pt"><FONT size=3><FONT face="Times New Roman"><SPAN>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; </SPAN>Any suggestion is appreciated, thank you in advance.</FONT></FONT></DIV>  <DIV class=MsoNormal style="MARGIN: 0in 0in 0pt"><SPAN><FONT face="Times New Roman" size=3>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; </FONT></SPAN></DIV>  <DIV class=MsoNormal style="MARGIN: 0in 0in 0pt"><FONT size=3><FONT face="Times New
 Roman"><SPAN>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; </SPAN>With best regards,</FONT></FONT></DIV>  <DIV class=MsoNormal style="MARGIN: 0in 0in 0pt"><FONT size=3><FONT face="Times New Roman"><SPAN>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;</SPAN><SPAN>&nbsp;&nbsp;</SPAN>Nagaraja Mulpuri.</FONT></FONT></DIV><p>&#32;

<hr size=1>We won't tell. Get more on <a href="http://us.rd.yahoo.com/evt=49980/*http://tv.yahoo.com/collections/265
">shows you hate to love</a><br>(and love to hate): <a href="http://us.rd.yahoo.com/evt=49980/*http://tv.yahoo.com/collections/265
">Yahoo! TV's Guilty Pleasures list.</a>