<!DOCTYPE HTML PUBLIC "-//W3C//DTD HTML 4.0 Transitional//EN">
<HTML><HEAD>
<META http-equiv=Content-Type content="text/html; charset=gb2312">
<META content="MSHTML 6.00.2900.3059" name=GENERATOR></HEAD>
<BODY>
<DIV><FONT face=Verdana><FONT size=2>Hi all,<BR>I'm a beginner to GMX,<BR>when I 
use the following command:<BR>"pdb2gmx -f 1G1S.pdb -p gr.top -o gr.gro 
-missing"</FONT></FONT></DIV>
<DIV>&nbsp;</DIV>
<DIV><FONT face=Verdana><FONT size=2>"WARNING: atom CD not found in residue 72 
while adding improper<BR>....<BR>Fatal error:<BR>Atom S in residue TYR 2 not 
found in rtp entry with 18 
atoms<BR>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 
while sorting atoms"</FONT></FONT></DIV>
<DIV>&nbsp;</DIV>
<DIV><FONT face=Verdana><FONT size=2>How to solve this fatal error? <BR>Thank 
you very much!<BR>Best 
wishes,<BR>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 
Yours, Winter</FONT></DIV></FONT></BODY></HTML>