Hello all,<br><br>&nbsp;&nbsp; I&#39;m looking into performing dihedral PCA, but first I need to make an appropiate index file. I would like to index the phi and psi angles for a protein. I&#39;ve searched in the archives but I didn&#39;t find anything clear enough. I know I must specify four atoms for each, but could someone kindly show me an example format?
<br><br>Thanks,<br>Russell Green<br>