Dear gromacs users,<br><br>Thank you for your answering my previous questions. <br>Here, I am in trouble again. <br>I continue the simulation of DNA, carbon nanatube and water. <br>I changed the names of atoms in cnt.pdb according to the names in 
ffamberXX.itp. <br>When I performed the energy minimization, the result I get is :<br><br>&quot;Fatal error:<br>Invalid order for directive defaults, file &quot;&quot;ffamber99.itp&quot;&quot;, line 4&quot;.<br><br>I checked back 
ffamber99.itp, the whole file is simple :<br>&quot;#define _FF_AMBER <br>&nbsp;#define _FF_AMBER99<br><br>[ defaults ]<br>; nbfunc&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; comb-rule&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; gen-pairs&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; fudgeLJ fudgeQQ<br>&nbsp; 1&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 2&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; yes&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 
0.5&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0.8333<br><br>#include &quot;ffamber99nb.itp&quot;<br>#include &quot;ffamber99bon.itp&quot;<br>&quot;<br><br>Can you give me some suggestions and help me out?<br>Also, I have a question regarding the residue names in amber99. 
<br>I guess that I may also need to change the residue of CNT(carbon nanotube)<br>according to the residue names used in ffamber99. <br>Do you think that it is necessary? And, how can I do it?<br><br>Thank you so much!<br>
<br>Bo<br><br><br>