I&#39;m trying to plot the chi angle of a specific a.a. residue as a

function of time.&nbsp; To do this, I&#39;m trying to use the -all flag and I&#39;m

having trouble generating any output files.&nbsp; Prior to trying -all, I

successfully created chi.log, order.xvg and dihcorr.xvg files.&nbsp; The

current command I am using looks like this:<br>&gt;&gt;&gt; g_chi -s (path to gro file) -f (path to trr file) -all &lt;&lt;&lt;<br>After running this: 1) the prompt line says &quot;warning: not all dihedrals found&quot; 2) there are no output files.

<br>First, tow do I get -all to work?&nbsp; Next, how can I get the chi v. time plot of an individual residue?<br>Thanks much.