Hi,<BR>&nbsp;<BR>I am a new gromacs user and have problems creating a topology file using the pdb2gmx command for simulating a six helix bundled alamethecin in lipid bilayer.<BR>when I use the command :<BR>pdb2gmx -f almN6start -o almN6start.gro -p almN6start.top<BR>&nbsp;<BR>I get the error :<BR>&nbsp;<BR>Program pdb2gmx, VERSION 3.3.1<BR>Source code file: pdb2gmx.c, line: 393<BR>Fatal error:<BR>Atom CA in residue ACE 1 not found in rtp entry with 6 atoms<BR>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; while sorting atoms<p>&#32;
      <hr size=1>Moody friends. Drama queens. Your life? Nope! - their life, your story.<br> <a href="http://us.rd.yahoo.com/evt=48224/*http://sims.yahoo.com/">Play Sims Stories at Yahoo! Games. </a>