<!DOCTYPE HTML PUBLIC "-//W3C//DTD HTML 4.0 Transitional//EN">
<HTML><HEAD>
<META http-equiv=Content-Type content="text/html; charset=utf-8">
<META content="MSHTML 6.00.2800.1106" name=GENERATOR></HEAD>
<BODY>
<DIV><SPAN class=187124217-24062007><FONT face=Arial color=#0000ff size=2>Hi 
Alan,</FONT></SPAN></DIV>
<DIV><SPAN class=187124217-24062007><FONT face=Arial color=#0000ff 
size=2></FONT></SPAN>&nbsp;</DIV>
<DIV><SPAN class=187124217-24062007><FONT face=Arial color=#0000ff size=2>You 
may use TOPOFIT. </FONT></SPAN></DIV>
<DIV><SPAN class=187124217-24062007><FONT face=Arial color=#0000ff 
size=2></FONT></SPAN>&nbsp;</DIV>
<DIV><SPAN class=187124217-24062007><FONT face=Arial color=#0000ff 
size=2>Caio.</FONT></SPAN></DIV>
<BLOCKQUOTE dir=ltr style="MARGIN-RIGHT: 0px">
  <DIV class=OutlookMessageHeader dir=ltr align=left><FONT face=Tahoma 
  size=2>-----Mensagem original-----<BR><B>De:</B> gmx-users-bounces@gromacs.org 
  [mailto:gmx-users-bounces@gromacs.org]<B>Em nome de </B>Alan<BR><B>Enviada 
  em:</B> domingo, 24 de junho de 2007 14:11<BR><B>Para:</B> 
  Gromacs<BR><B>Assunto:</B> [gmx-users] superimpose 
pdbs<BR><BR></FONT></DIV>Hi!
  <DIV><BR class=webkit-block-placeholder></DIV>
  <DIV>It may be a bit GMX off-topic: I am looking for a command line 
  superimpose application that would be able to get all individual pdb files in 
  folder and generated new pdb versions of them 3D superimposed. </DIV>
  <DIV><BR class=webkit-block-placeholder></DIV>
  <DIV>Something like what SuperPose (<A 
  href="http://wishart.biology.ualberta.ca/SuperPose/help.html">http://wishart.biology.ualberta.ca/SuperPose/help.html</A>) 
  does, but then locally in my computer. </DIV>
  <DIV><BR class=webkit-block-placeholder></DIV>
  <DIV>Many thanks in advance.</DIV>
  <DIV><BR class=webkit-block-placeholder></DIV>
  <DIV>Cheers,</DIV>
  <DIV>Alan</DIV>
  <DIV><BR>-- <BR>Alan Wilter S. da Silva, D.Sc. - CCPN Research Associate 
  <BR>Department of Biochemistry, University of Cambridge.<BR>80 Tennis Court 
  Road, Cambridge CB2 1GA, UK.<BR>&gt;&gt;<A 
  href="http://www.bio.cam.ac.uk/~awd28">http://www.bio.cam.ac.uk/~awd28</A>&lt;&lt; 
  </DIV></BLOCKQUOTE></BODY></HTML>