<div>Hello all,</div>
<div>&nbsp;</div>
<div>Because of&nbsp;the limitations in run time, my simulations&nbsp;have broken into three parts:&nbsp;one.trr, two.trr, and three.trr. Each&nbsp;run has&nbsp;its corresponding tpr file. The original tpr file (minimization step)&nbsp;was start.tpr. Now using trjconv for 
three.trr which tpr file I need to type after -s option? </div>
<div>&nbsp;</div>
<div>trjconv -f three.trr -s start.tpr ....</div>
<div>&nbsp;</div>
<div>I am aware that the topology (information in the starting top file) will remain intact during simulation. I am wondering whether commands like trjconv read anything more than topology information&nbsp; (MD parameters, etc) from&nbsp;the -s option? In other words, in the above example replacing 
start.tpr with three.tpr will not change the&nbsp;outcome?&nbsp;</div>
<div><br><br>Cheers,<br>Terry </div>