<div>Hi&nbsp; all !</div>  <div>We want to MD simulation of a protein-protein complex.We can't prepare itp. and gro files with PRODRG server.Because there are too many atoms in&nbsp;my ligand (which is a protein).&nbsp;How can we prepare the .itp and .gro files?Are there any tutorial for a protein protein complex?</div>  <div>&nbsp;</div>  <div>&nbsp;</div>  <div>Best Regard<BR>&nbsp;Fulya</div>  <div>&nbsp;</div>  <div>Hacettepe University</div>  <div>Turkey</div><p>&#32;
      <hr size=1>Building a website is a piece of cake. <br>Yahoo! Small Business gives you <a href="http://us.rd.yahoo.com/evt=48251/*http://smallbusiness.yahoo.com/webhosting/?p=PASSPORTPLUS">all the tools to get online.</a>