Hi All,<br>I am trying to energy minimization for a protein in water and minimum energy I am getting is -3.2362996e+07. I want to do normal mode analysis, and its saying that force is not small enough. I am also getting negative eigen values with this run. How can I further minimize my structure in order to perform normal mode analysis? Any suggestion is welcome.<br><br>Regards,<br><br><br><br><br><br><br><br><br><br><br><br><br><br><br><br><BR><BR><DIV><FONT color=#0000bf size=4></FONT>&nbsp;</DIV>  <DIV><FONT color=#0000bf><STRONG>Anirban Ghosh</STRONG></FONT></DIV>  <DIV><FONT color=#0000bf><STRONG>M.Tech Bioinformatics</STRONG></FONT></DIV>  <DIV><FONT color=#0000bf><STRONG>University of Hyderabad</STRONG></FONT></DIV>  <DIV><FONT color=#0000bf><STRONG>Hyderabad - 500 046</STRONG></FONT></DIV>  <DIV><FONT color=#0000bf><STRONG>Andhra Pradesh</STRONG></FONT></DIV>  <DIV><FONT color=#0000bf><STRONG>India</STRONG></FONT></DIV><p>&#32;Send free SMS to your Friends on Mobile
 from your Yahoo! Messenger. Download Now! http://messenger.yahoo.com/download.php