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<div class=Section1><pre>&#8230;. OK.<o:p></o:p></pre><pre>Again, the shipping Win32 version of cpp.exe is perfectly working with Gromacs 64-bit on a opetron m/c which is a x86-64 box.<o:p></o:p></pre><pre>But I guess it (the above cpp.exe) may not work on pure x64 m/c as its not a valid x64 application.<o:p></o:p></pre><pre>Is there a x64 port of cpp.exe is available ?<o:p></o:p></pre><pre>Can we use other (native windows) c preprocessor ?<o:p></o:p></pre><pre><o:p>&nbsp;</o:p></pre><pre>Sorry, if I&#8217;m making silly queries.<o:p></o:p></pre><pre><o:p>&nbsp;</o:p></pre>

<div style='mso-element:para-border-div;border:none;border-bottom:double windowtext 2.25pt;
padding:0in 0in 1.0pt 0in'><pre style='border:none;padding:0in'>Thank you<o:p></o:p></pre></div>

<pre><o:p>&nbsp;</o:p></pre><pre><o:p>&nbsp;</o:p></pre><pre><o:p>&nbsp;</o:p></pre><pre>Hi Utkal,<o:p></o:p></pre><pre><o:p>&nbsp;</o:p></pre><pre>Cpp.exe is called by grompp to preprocess the topology.<o:p></o:p></pre><pre><o:p>&nbsp;</o:p></pre><pre>Tsjerk<o:p></o:p></pre><pre><o:p>&nbsp;</o:p></pre><pre>On 7/18/07, Utkal Ranjan Pradhan &lt;<a
href="http://www.gromacs.org/mailman/listinfo/gmx-users">urpradhan at gmail.com</a>&gt; wrote:<o:p></o:p></pre><pre>&gt;<i><o:p>&nbsp;</o:p></i></pre><pre>&gt;<i><o:p>&nbsp;</o:p></i></pre><pre>&gt;<i><o:p>&nbsp;</o:p></i></pre><pre>&gt;<i><o:p>&nbsp;</o:p></i></pre><pre>&gt;<i> Thank you for your reply.<o:p></o:p></i></pre><pre>&gt;<i><o:p>&nbsp;</o:p></i></pre><pre>&gt;<i><o:p>&nbsp;</o:p></i></pre><pre>&gt;<i><o:p>&nbsp;</o:p></i></pre><pre>&gt;<i> But still confused WHY CPP.EXE IS REQUIRED AT RUNTIME ?<o:p></o:p></i></pre><pre>&gt;<i><o:p>&nbsp;</o:p></i></pre><pre>&gt;<i> (Note that, I can build gromacs without cpp.exe with MS VS 2005, but while<o:p></o:p></i></pre><pre>&gt;<i> running applications like mdrun, it looks for cpp.exe L)<o:p></o:p></i></pre><pre>&gt;<i><o:p>&nbsp;</o:p></i></pre><pre>&gt;<i><o:p>&nbsp;</o:p></i></pre><pre>&gt;<i><o:p>&nbsp;</o:p></i></pre><pre>&gt;<i><o:p>&nbsp;</o:p></i></pre><pre>&gt;<i><o:p>&nbsp;</o:p></i></pre><pre>&gt;<i> Thank You;<o:p></o:p></i></pre><pre>&gt;<i><o:p>&nbsp;</o:p></i></pre><pre>&gt;<i> URPradhan At Gmail Dot Com<o:p></o:p></i></pre><pre>&gt;<i><o:p>&nbsp;</o:p></i></pre><pre>&gt;<i><o:p>&nbsp;</o:p></i></pre><pre>&gt;<i> David van der Spoel wrote:<o:p></o:p></i></pre><pre>&gt;<i> &gt; Utkal Ranjan Pradhan wrote:<o:p></o:p></i></pre><pre>&gt;<i> &gt;&gt; Friends<o:p></o:p></i></pre><pre>&gt;<i> &gt;&gt;<o:p></o:p></i></pre><pre>&gt;<i> &gt;&gt;<o:p></o:p></i></pre><pre>&gt;<i> &gt;&gt;<o:p></o:p></i></pre><pre>&gt;<i> &gt;&gt; As I know cpp.exe is a GNU port for C Preprocessor for Windows and<o:p></o:p></i></pre><pre>&gt;<i> &gt;&gt; which is required to compile the Gromacs code.<o:p></o:p></i></pre><pre>&gt;<i> &gt;&gt;<o:p></o:p></i></pre><pre>&gt;<i> &gt;&gt; But I'm confused, Why it is required during runtime of Gromacs<o:p></o:p></i></pre><pre>&gt;<i> &gt;&gt; applications ?<o:p></o:p></i></pre><pre>&gt;<i> &gt;&gt;<o:p></o:p></i></pre><pre>&gt;<i> &gt;&gt; And I have the Win32 version of cpp.exe, will it work for x64 (=Win64) ?<o:p></o:p></i></pre><pre>&gt;<i> &gt;&gt;<o:p></o:p></i></pre><pre>&gt;<i> &gt;&gt; What is the Windows native equivalent of cpp.exe ? Is it cl.exe ?<o:p></o:p></i></pre><pre>&gt;<i> &gt;&gt;<o:p></o:p></i></pre><pre>&gt;<i> &gt;&gt; How can I remove the runtime dependency of cpp.exe for gromacs<o:p></o:p></i></pre><pre>&gt;<i> &gt;&gt; applications ?<o:p></o:p></i></pre><pre>&gt;<i> &gt;<o:p></o:p></i></pre><pre>&gt;<i> &gt; by writing an implementation of the cpp and donating it to the gromacs<o:p></o:p></i></pre><pre>&gt;<i> &gt; project. In fact, it wouldn't be so hard, since we are only using a few<o:p></o:p></i></pre><pre>&gt;<i> &gt; features in practice:<o:p></o:p></i></pre><pre>&gt;<i> &gt; #include<o:p></o:p></i></pre><pre>&gt;<i> &gt; #ifdef #else #endif<o:p></o:p></i></pre><pre>&gt;<i> &gt; #define<o:p></o:p></i></pre><pre>&gt;<i> &gt;<o:p></o:p></i></pre><pre>&gt;<i> &gt; Please provide a simple C program that takes a file, searches for these<o:p></o:p></i></pre><pre>&gt;<i> &gt; commands and does the same what the cpp does.<o:p></o:p></i></pre><pre>&gt;<i> &gt;<o:p></o:p></i></pre><pre>&gt;<i> &gt;<o:p></o:p></i></pre><pre>&gt;<i> see also<o:p></o:p></i></pre><pre>&gt;<i> <a
href="http://wiki.gromacs.org/index.php/Cpp_replacement">http://wiki.gromacs.org/index.php/Cpp_replacement</a><o:p></o:p></i></pre><pre>&gt;<i><o:p>&nbsp;</o:p></i></pre><pre>&gt;<i> --<o:p></o:p></i></pre><pre>&gt;<i> David van der Spoel, Ph.D.<o:p></o:p></i></pre><pre>&gt;<i> Molec. Biophys. group, Dept. of Cell &amp; Molec. Biol., Uppsala University.<o:p></o:p></i></pre><pre>&gt;<i> Box 596, 75124 Uppsala, Sweden. Phone:&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; +46184714205. Fax:<o:p></o:p></i></pre><pre>&gt;<i> +4618511755.<o:p></o:p></i></pre><pre>&gt;<i> spoel at xray.bmc.uu.se&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; spoel at gromacs.org<o:p></o:p></i></pre><pre>&gt;<i> <a
href="http://folding.bmc.uu.se">http://folding.bmc.uu.se</a><o:p></o:p></i></pre><pre>&gt;<i><o:p>&nbsp;</o:p></i></pre><pre>&gt;<i><o:p>&nbsp;</o:p></i></pre><pre>&gt;<i><o:p>&nbsp;</o:p></i></pre><pre>&gt;<i> _______________________________________________<o:p></o:p></i></pre><pre>&gt;<i> gmx-users mailing list&nbsp;&nbsp;&nbsp; <a
href="http://www.gromacs.org/mailman/listinfo/gmx-users">gmx-users at gromacs.org</a><o:p></o:p></i></pre><pre>&gt;<i> <a
href="http://www.gromacs.org/mailman/listinfo/gmx-users">http://www.gromacs.org/mailman/listinfo/gmx-users</a><o:p></o:p></i></pre><pre>&gt;<i> Please search the archive at <a
href="http://www.gromacs.org/search">http://www.gromacs.org/search</a> before posting!<o:p></o:p></i></pre><pre>&gt;<i> Please don't post (un)subscribe requests to the list. Use the<o:p></o:p></i></pre><pre>&gt;<i> www interface or send it to <a
href="http://www.gromacs.org/mailman/listinfo/gmx-users">gmx-users-request at gromacs.org.</a><o:p></o:p></i></pre><pre>&gt;<i> Can't post? Read<o:p></o:p></i></pre><pre>&gt;<i> <a
href="http://www.gromacs.org/mailing_lists/users.php">http://www.gromacs.org/mailing_lists/users.php</a><o:p></o:p></i></pre><pre>&gt;<i><o:p>&nbsp;</o:p></i></pre><pre><o:p>&nbsp;</o:p></pre><pre><o:p>&nbsp;</o:p></pre><pre>-- <o:p></o:p></pre><pre>Tsjerk A. Wassenaar, Ph.D.<o:p></o:p></pre><pre>Junior UD (post-doc)<o:p></o:p></pre><pre>Biomolecular NMR, Bijvoet Center<o:p></o:p></pre><pre>Utrecht University<o:p></o:p></pre><pre>Padualaan 8<o:p></o:p></pre><pre>3584 CH Utrecht<o:p></o:p></pre><pre>The Netherlands<o:p></o:p></pre><pre>P: +31-30-2539931<o:p></o:p></pre><pre>F: +31-30-2537623<o:p></o:p></pre>

<p class=MsoNormal><o:p>&nbsp;</o:p></p>

<p class=MsoNormal><o:p>&nbsp;</o:p></p>

<p class=MsoNormal><span style='font-size:8.0pt;font-family:"Times New Roman","serif";
color:#4BACC6'><o:p>&nbsp;</o:p></span></p>

<p class=MsoNormal><span style='font-size:8.0pt;color:#4BACC6'>Thank You;<o:p></o:p></span></p>

<p class=MsoNormal><span style='font-size:8.0pt;color:#4BACC6'>URPradhan At
Gmail Dot Com<o:p></o:p></span></p>

<p class=MsoNormal><o:p>&nbsp;</o:p></p>

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