<!DOCTYPE HTML PUBLIC "-//W3C//DTD HTML 3.2//EN">
<HTML>
<HEAD>
<META HTTP-EQUIV="Content-Type" CONTENT="text/html; charset=iso-8859-1">
<META NAME="Generator" CONTENT="MS Exchange Server version 6.5.7652.24">
<TITLE>mdp files gromacs 3.3</TITLE>
</HEAD>
<BODY>
<!-- Converted from text/plain format -->

<P><FONT SIZE=2>Dear all,<BR>
<BR>
I am using gromacs 3.3-1, ff G53a6.<BR>
When using mdp files, as for example for a relax_md, I got the following error messages:<BR>
<BR>
WARNING 1 [file relax.mdp, line unknown]:<BR>
&nbsp; Unknown left-hand 'bd-temp' in parameter file<BR>
<BR>
WARNING 2 [file relax.mdp, line unknown]:<BR>
&nbsp; Unknown left-hand 'zero-temp_time' in parameter file<BR>
<BR>
I got the mdp file from gromacs website: mdp file format<BR>
<BR>
I also tried the one I was using before for gromacs 3.0, and I got exactly the same error message.<BR>
<BR>
Any help would be appreciated.<BR>
<BR>
Thanks in advance,<BR>
Luciane<BR>
<BR>
<BR>
<BR>
Dr Luciane Vieira de Mello&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;<BR>
School of Biological Sciences&nbsp;&nbsp; &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; &nbsp;<BR>
Room 2.20, Life Science Building<BR>
Tel:(+44) 151 795 5140<BR>
FAX:(+44) 151 794 5130<BR>
University of Liverpool<BR>
Crown St.,Liverpool L69 7ZB, U.K.<BR>
<BR>
<BR>
</FONT>
</P>

</BODY>
</HTML>