Hello there,<br><br>I am trying to run some simulations in attempts to calculate binding free energy between ligands and a protein using the FEP method, but until now I did not have any success. I have been looking for bibliography over this subject, but, as you may know, there aren&#39;t many works about FEP. What I found is one job where the solvation of amino acids analogs was calculated, but there wasn&#39;t any mention about the usage of the method in protein-ligand systems. What I would like to ask is: Is it possible to develop work over free energy calculations using the FEP method in protein-ligand systems?
<br><br>Thanks a lot,<br>Diego Nolasco<br>