Hi all again.<br><br>Sorry for bothering all you with this dihedrals subject.<br><br>Well, I&#39;m trying this in my .itp file:<br><br>**************************************************************<br>[ dihedraltypes ]<br>
;&nbsp; i&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; j&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; k&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; l&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; funct&nbsp;&nbsp;&nbsp; phi (degree)&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; cp (kJ/mol.rad^2)&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; mult(n)<br>&nbsp;&nbsp; CT&nbsp;&nbsp;&nbsp; CT&nbsp;&nbsp;&nbsp; NT&nbsp;&nbsp;&nbsp; CT&nbsp;&nbsp;&nbsp; 1&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0.00&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 1.25520&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 3.0&nbsp; ;amber99<br>&nbsp;&nbsp; CT&nbsp;&nbsp;&nbsp; CT&nbsp;&nbsp;&nbsp; NT&nbsp;&nbsp;&nbsp; CT&nbsp;&nbsp;&nbsp; 1&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 180.00
&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 2.00832&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 2.0&nbsp; ;amber99<br>&nbsp;&nbsp; X&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; CT&nbsp;&nbsp;&nbsp; NT&nbsp;&nbsp;&nbsp; X&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 1&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0.00&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 1.25520&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 3.0&nbsp; ;amber99&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; ;padrao<br>&nbsp;&nbsp; CT&nbsp;&nbsp;&nbsp; CT&nbsp;&nbsp;&nbsp; CT&nbsp;&nbsp;&nbsp; CT&nbsp;&nbsp;&nbsp; 1&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0.00&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 
0.75312&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 3.0&nbsp; ;amber99<br>&nbsp;&nbsp; CT&nbsp;&nbsp;&nbsp; CT&nbsp;&nbsp;&nbsp; CT&nbsp;&nbsp;&nbsp; CT&nbsp;&nbsp;&nbsp; 1&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 180.00&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 1.04600&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 2.0&nbsp; ;amber99<br>&nbsp;&nbsp; CT&nbsp;&nbsp;&nbsp; CT&nbsp;&nbsp;&nbsp; CT&nbsp;&nbsp;&nbsp; CT&nbsp;&nbsp;&nbsp; 1&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 180.00&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0.83680&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 1.0&nbsp; ;amber99
<br>&nbsp;&nbsp; F&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; CT&nbsp;&nbsp;&nbsp; CT&nbsp;&nbsp;&nbsp; F&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 1&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0.00&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0.0000&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 3.0&nbsp; ;amber99<br>&nbsp;&nbsp; F&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; CT&nbsp;&nbsp;&nbsp; CT&nbsp;&nbsp;&nbsp; F&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 1&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 180.00&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 5.20800&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 1.0&nbsp; ;amber99<br>&nbsp;&nbsp; X&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; CT&nbsp;&nbsp;&nbsp; CT&nbsp;&nbsp;&nbsp; X&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 1&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 
0.00&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0.6530&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 3.0&nbsp; ;amber original e 99 ;padrao<br>********************************************************************<br><br>But I just found that grompp is yelding this for me:<br><br>**********************************************************************
<br>processing topology...<br>WARNING 1 [file &quot;../top/ff_amber_perF.itp&quot;, line 62]:<br>&nbsp; Overriding Proper Dih. parameters,<br>&nbsp; old: 0 1.2552 3 0 0 0<br>&nbsp; new: CT CT NT CT 1 180.00 2.00832 2.0<br><br>WARNING 2 [file &quot;../top/ff_amber_perF.itp&quot;, line 65]:
<br>&nbsp; Overriding Proper Dih. parameters,<br>&nbsp; old: 0 0.75312 3 0 0 0<br>&nbsp; new: CT CT CT CT 1 180.00 1.04600 2.0<br><br>WARNING 3 [file &quot;../top/ff_amber_perF.itp&quot;, line 66]:<br>&nbsp; Overriding Proper Dih. parameters,
<br>&nbsp; old: 180 1.046 2 0 0 0<br>&nbsp; new: CT CT CT CT 1 180.00 0.83680 1.0<br><br>WARNING 4 [file &quot;../top/ff_amber_perF.itp&quot;, line 68]:<br>&nbsp; Overriding Proper Dih. parameters,<br>&nbsp; old: 0 0 3 0 0 0<br>&nbsp; new: F CT CT F 1 
180.00 5.20800 1.0<br>*******************************************************************<br><br>What does it mean? What kind of mistake am I doing? Am I wrong, or definitelly gromacs still doesn&#39;t support multiple trigonometric dihedral potentials and then I really need to transform it on a RB-potential (and the reference I found on a web site is wrong)?
<br><br>Thanks a lot in advance... Any help would be really welcome.&nbsp; :)<br><br>Sincerally yours,<br><br>Jones<br>