Hi, everyone:<br />I have meet some problem when simulating a protein and ATP complex. The energy minimization will stop after 14 steps. I had followed Mark's suggestion, did the protein and ATP eneryg minimization independently, and&#160; found that the protein can finish its minimization correctly, but&#160; the&#160; ATP 's minimization stopped after 14 steps. So it seems that there are something wrong with ATP. And Mark also said &quot;Probably your topology is broken&quot;, what is it means? What should I do now?<br />Best wishes!<br />