Respected sir/madem,<br>
i am using gromacs - 3.1.4&nbsp; version on sunsolaris platform.i got
error at position restrain at grompp step ,telling dat&nbsp; NO SUCH
MOLECULE TYPE NA+(both are in caps).beofre dat the error which i got ,
ihv done following steps<br>
1.first i hv excuted pdb2gmx command den i noted down the charge which given as out put.charge is -1<br>
2.after editconf(-d 0.9),genbox ,energy
minimization(grompp,mdrun)&nbsp; i had manipulated da&nbsp; .top file
by adding #include &#39;ions.itp,removed one water molecloe from SOL and
added NA+&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 1 at da end of topology file .<br>
den i got error after runing da grompp of position restrain ,and i had
changed pr.mdp file ,in that i was added da SOL,0.1,300 (temp)<br>
thanking u for ur patiency<br>
regards<br>
vijaya kumar hinge<br>