<DIV>&nbsp; Hi all!<BR>&nbsp;I have a protein-protein complex in my simulation so&nbsp;I used the pdb2gmx command&nbsp;<BR>for getting the .itp file. Then i added the corresponding .itp file in the top file .<BR></DIV>  <DIV>While running the grompp i am getting the following error:</DIV>  <DIV>&nbsp;</DIV>  <DIV class=MsoNormal style="MARGIN: 0cm 0cm 0pt"><FONT face="Times New Roman" size=3>ERROR 1 [file "drg.itp", line 7]:</FONT></DIV>  <DIV class=MsoNormal style="MARGIN: 0cm 0cm 0pt; TEXT-INDENT: 6pt"><FONT size=3><FONT face="Times New Roman"><SPAN style="mso-spacerun: yes">&nbsp; </SPAN>Incorrect number of atomtypes for dihedral (4 instead of 2 or 4)</FONT></FONT></DIV>  <DIV class=MsoNormal style="MARGIN: 0cm 0cm 0pt; TEXT-INDENT: 6pt"><FONT face="Times New Roman" size=3>ERROR 2 [file "drg.itp", line 8]:</FONT></DIV>  <DIV class=MsoNormal style="MARGIN: 0cm 0cm 0pt; TEXT-INDENT: 6pt"><FONT size=3><FONT face="Times New Roman"><SPAN style="mso-spacerun: yes">&nbsp;
 </SPAN>Incorrect number of atomtypes for dihedral (4 instead of 2 or 4)</FONT></FONT></DIV>  <DIV class=MsoNormal style="MARGIN: 0cm 0cm 0pt; TEXT-INDENT: 6pt"><FONT face="Times New Roman" size=3>ERROR 3 [file "drg.itp", line 9]:</FONT></DIV>  <DIV class=MsoNormal style="MARGIN: 0cm 0cm 0pt; TEXT-INDENT: 6pt"><FONT size=3><FONT face="Times New Roman"><SPAN style="mso-spacerun: yes">&nbsp; </SPAN>Incorrect number of atomtypes for dihedral (4 instead of 2 or 4)..............</FONT></FONT></DIV>  <DIV class=MsoNormal style="MARGIN: 0cm 0cm 0pt; TEXT-INDENT: 6pt"><FONT face="Times New Roman" size=3></FONT>&nbsp;</DIV>  <DIV class=MsoNormal style="MARGIN: 0cm 0cm 0pt; TEXT-INDENT: 6pt"><FONT face="Times New Roman" size=3>But when I checked the .itp file it is exactly same the .itp file of my successful simulations of the ligand protein.</FONT></DIV>  <DIV class=MsoNormal style="MARGIN: 0cm 0cm 0pt; TEXT-INDENT: 6pt"><FONT size=+0>I would be very grateful<FONT face="Times New
 Roman" size=3> to know why I get this type of error and what can I do about this.<SPAN>&nbsp; </SPAN>Thanks very much.</FONT></FONT></DIV>  <DIV class=MsoNormal style="MARGIN: 0cm 0cm 0pt; TEXT-INDENT: 6pt"><FONT size=3><FONT face="Times New Roman">Best Regard<BR>&nbsp;&nbsp; Fulya</DIV>  <DIV>&nbsp;</DIV>  <DIV>Hacettepe University</DIV>  <DIV>Turkey</DIV></FONT></FONT>  <DIV class=MsoNormal style="MARGIN: 0cm 0cm 0pt; TEXT-INDENT: 6pt"><FONT face="Times New Roman" size=3></FONT>&nbsp;</DIV>  <DIV><BR><BR>&nbsp;</DIV><p>&#32;
      <hr size=1>Looking for a deal? <a href="http://us.rd.yahoo.com/evt=47094/*http://farechase.yahoo.com/;_ylc=X3oDMTFicDJoNDllBF9TAzk3NDA3NTg5BHBvcwMxMwRzZWMDZ3JvdXBzBHNsawNlbWFpbC1uY20-">Find great prices on flights and hotels</a> with Yahoo! FareChase.