And the Potential is also positive. I cannot explain this as well. <br><br><div><span class="gmail_quote">On 9/5/07, <b class="gmail_sendername">uki zhu</b> &lt;<a href="mailto:ukizhu@gmail.com">ukizhu@gmail.com</a>&gt; wrote:
</span><blockquote class="gmail_quote" style="border-left: 1px solid rgb(204, 204, 204); margin: 0pt 0pt 0pt 0.8ex; padding-left: 1ex;">Hi, gmx-users,<br>These days I am trying to do some systems about carbon tubes. And I found Total Energy of the system is positive&nbsp; whether Energy Minimization or MD. The amount of Total Energy is about&nbsp; E03. 
<br><br>For example,
<br>&quot;&quot; &nbsp;  <br>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; <span style="font-weight: bold; background-color: rgb(255, 255, 51);">Step&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; Time&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; Lambda</span><br style="font-weight: bold; background-color: rgb(255, 255, 51);"><span style="font-weight: bold; background-color: rgb(255, 255, 51);">


&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 5000&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 5.00000&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0.00000</span><br style="font-weight: bold; background-color: rgb(255, 255, 51);"><br style="font-weight: bold; background-color: rgb(255, 255, 51);"><span style="font-weight: bold; background-color: rgb(255, 255, 51);">


&nbsp;&nbsp; Energies (kJ/mol)</span><br style="font-weight: bold; background-color: rgb(255, 255, 51);"><span style="font-weight: bold; background-color: rgb(255, 255, 51);">&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; Morse&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; G96Angle&nbsp;&nbsp;&nbsp; Proper Dih.&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; LJ (SR)&nbsp;&nbsp; Coulomb (SR)
</span><br style="font-weight: bold; background-color: rgb(255, 255, 51);"><span style="font-weight: bold; background-color: rgb(255, 255, 51);">&nbsp;&nbsp;&nbsp; 5.92521e+02&nbsp;&nbsp;&nbsp; 9.76865e+02&nbsp;&nbsp;&nbsp; 6.24199e+03&nbsp;&nbsp; -1.72019e+03&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0.00000e+00

</span>
<br style="font-weight: bold; background-color: rgb(255, 255, 51);"><span style="font-weight: bold; background-color: rgb(255, 255, 51);">&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; Potential&nbsp;&nbsp;&nbsp; Kinetic En.&nbsp;&nbsp; Total Energy&nbsp;&nbsp;&nbsp; Temperature Pressure (bar)</span>

<br style="font-weight: bold; background-color: rgb(255, 255, 51);">
<span style="font-weight: bold; background-color: rgb(255, 255, 51);">&nbsp;&nbsp;&nbsp; 6.09119e+03&nbsp;&nbsp;&nbsp; 3.32193e+03&nbsp;&nbsp;&nbsp; 9.41312e+03&nbsp;&nbsp;&nbsp; 3.02677e+02&nbsp;&nbsp;&nbsp; 8.29506e-02</span><br>&quot;&quot;<br>in a log file.<br><br>Is anyone who can help me to solve this problem?
<br><br>Thanks very much.<br><span class="sg"><br>uki<br>
</span></blockquote></div><br>