Hi All,<br>I want to do ED analysis along first principle component in GROMACS. I am trying to make the .edi file through make_edi command. But cannot understand which option to pick among -linfix. -linacc, -radfix, -radacc, -radcon. I also cannot understand how to specify the option(string) for this in the make_edi command. Please&nbsp; tell me how to execute this command. Any suggestion is welcome.<br><br>Regards,<br><BR><BR><DIV><FONT color=#0000bf size=4></FONT>&nbsp;</DIV>  <DIV><FONT color=#0000bf><STRONG>Anirban Ghosh</STRONG></FONT></DIV>  <DIV><FONT color=#0000bf><STRONG>M.Tech Bioinformatics</STRONG></FONT></DIV>  <DIV><FONT color=#0000bf><STRONG>University of Hyderabad</STRONG></FONT></DIV>  <DIV><FONT color=#0000bf><STRONG>Hyderabad - 500 046</STRONG></FONT></DIV>  <DIV><FONT color=#0000bf><STRONG>Andhra Pradesh</STRONG></FONT></DIV>  <DIV><FONT color=#0000bf><STRONG>India</STRONG></FONT></DIV><p>&#32;


      <!--10--><hr size=1></hr> Try the revolutionary next-gen Yahoo! Mail. <a href="http://in.rd.yahoo.com/tagline_mail_10/*http://mrd.mail.yahoo.com/dc/landing">Click here.</a>