<!DOCTYPE HTML PUBLIC "-//W3C//DTD HTML 3.2//EN">
<HTML>
<HEAD>
<META HTTP-EQUIV="Content-Type" CONTENT="text/html; charset=iso-8859-1">
<META NAME="Generator" CONTENT="MS Exchange Server version 6.5.7652.24">
<TITLE>RE: [gmx-users] g_energy -fee -inf problem</TITLE>
</HEAD>
<BODY>
<!-- Converted from text/plain format -->

<P><FONT SIZE=2>Thanks Mark for pointing out my error.<BR>
I will do it accordingly.<BR>
<BR>
With best regards,<BR>
<BR>
Abu Naser<BR>
<BR>
School Of Life Sciences<BR>
Heriot-Watt University<BR>
Edinburgh EH14 4AS<BR>
Email: mn2@hw.ac.uk<BR>
Phone: +44(0)1314518265<BR>
Fax : +44(0) 131 451 3009<BR>
<BR>
<BR>
<BR>
<BR>
<BR>
<BR>
-----Original Message-----<BR>
From: gmx-users-bounces@gromacs.org on behalf of Mark Abraham<BR>
Sent: Mon 24/09/2007 9:22 AM<BR>
To: Discussion list for GROMACS users<BR>
Subject: Re: [gmx-users] g_energy -fee -inf problem<BR>
<BR>
Naser, Md Abu wrote:<BR>
&gt; Hi Mark,<BR>
&gt;<BR>
&gt; The reacton shuld occur as: R-S-S-R + 2H+ -----&gt; 2R-SH.<BR>
<BR>
So at the very least, your &quot;after&quot; topology will need to have these<BR>
hydrogens... You can't just cleave the S-S bond out of the .top and<BR>
expect it to work.<BR>
<BR>
Mark<BR>
_______________________________________________<BR>
gmx-users mailing list&nbsp;&nbsp;&nbsp; gmx-users@gromacs.org<BR>
<A HREF="http://www.gromacs.org/mailman/listinfo/gmx-users">http://www.gromacs.org/mailman/listinfo/gmx-users</A><BR>
Please search the archive at <A HREF="http://www.gromacs.org/search">http://www.gromacs.org/search</A> before posting!<BR>
Please don't post (un)subscribe requests to the list. Use the<BR>
www interface or send it to gmx-users-request@gromacs.org.<BR>
Can't post? Read <A HREF="http://www.gromacs.org/mailing_lists/users.php">http://www.gromacs.org/mailing_lists/users.php</A><BR>
<BR>
</FONT>
</P>

</BODY>
</HTML>