Hi Vijaya,<br><br>Did you note that tpbconv -extend extends the _remaining_ runtime with the amount given. So if the frame used for the continuation run had 140 ps remaining and you use -extend 5, you&#39;ll have 145 to go.
<br><br>Tsjerk<br><br><div><span class="gmail_quote">On 10/8/07, <b class="gmail_sendername">Mark Abraham</b> &lt;<a href="mailto:Mark.Abraham@anu.edu.au">Mark.Abraham@anu.edu.au</a>&gt; wrote:</span><blockquote class="gmail_quote" style="border-left: 1px solid rgb(204, 204, 204); margin: 0pt 0pt 0pt 0.8ex; padding-left: 1ex;">
vijaya subramanian wrote:<br>&gt; Hi<br>&gt; When I submit continuation runs with the following commands I find that the the run is not extended for the time set by the tpbconv (5 ps) command but an arbitrary time of 145 ps.
<br>&gt;<br>&gt; tpbconv -s full3.tpr -f full3.trr -extend 5 -time 1150 -o full4tc.tpr<br><br>What output do you get here?<br><br>Mark<br>_______________________________________________<br>gmx-users mailing list&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;<a href="mailto:gmx-users@gromacs.org">
gmx-users@gromacs.org</a><br><a href="http://www.gromacs.org/mailman/listinfo/gmx-users">http://www.gromacs.org/mailman/listinfo/gmx-users</a><br>Please search the archive at <a href="http://www.gromacs.org/search">http://www.gromacs.org/search
</a> before posting!<br>Please don&#39;t post (un)subscribe requests to the list. Use the<br>www interface or send it to <a href="mailto:gmx-users-request@gromacs.org">gmx-users-request@gromacs.org</a>.<br>Can&#39;t post? Read 
<a href="http://www.gromacs.org/mailing_lists/users.php">http://www.gromacs.org/mailing_lists/users.php</a><br></blockquote></div><br><br clear="all"><br>-- <br>Tsjerk A. Wassenaar, Ph.D.<br>Junior UD (post-doc)<br>Biomolecular NMR, Bijvoet Center
<br>Utrecht University<br>Padualaan 8 <br>3584 CH Utrecht<br>The Netherlands<br>P: +31-30-2539931&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;<br>F: +31-30-2537623