Hello,<br><br>I&#39;m very new to Gromacs, and I am interested in
simulating the interactions of 2 hexadecane (C16H34) molecules in water
(SPC/E specificall).&nbsp; I&#39;ve spent some time experimenting with tutorials
in Gromacs, but I&#39;ve found little help in non-protein simulations like
this one.
<br><br>I&#39;ve built topologies for hexadecane compatible with NAMD,
so I figure I should be able to do the same in Gromacs but I&#39;m fuzzy on
how to go about doing so (what files to edit).&nbsp; I was also hoping to get some input on which forcefield would be best for this sort of system.
<br><br>I&#39;d greatly appreciate it if someone could give me some pointers on how to get started here.<br><br>Thanks very much,<br><span class="sg">Adam</span>