Hi Anupam,<br><br>The problem will more likely be in the computational resources you have :) Definitely not in Gromacs... (as far as it concerns the feasibility of simulating a large protein in a membrane).<br><br>Cheers,<br>
<br>Tsjerk<br><br><br><br><div><span class="gmail_quote">On 10/15/07, <b class="gmail_sendername">Anupam Nath Jha</b> &lt;<a href="mailto:anupam@mbu.iisc.ernet.in">anupam@mbu.iisc.ernet.in</a>&gt; wrote:</span><blockquote class="gmail_quote" style="border-left: 1px solid rgb(204, 204, 204); margin: 0pt 0pt 0pt 0.8ex; padding-left: 1ex;">
<br><br>Dear all<br><br>i want to go for simulation of a protein of size of around 1000residues and then<br>there will be lipids also.<br>is it feasible or some problem will come.<br><br>thanks in advance<br>anupam<br><br>
<br><br><br>--<br>Science is facts; just as houses are made of stone, so is science is made of<br>facts; but a pile of stones is not a house, and&nbsp;&nbsp;a collection of facts is not<br>necessarily science.<br><br>Anupam Nath Jha
<br>Ph. D. Student<br>Saraswathi Vishveshwara Lab<br>Molecular Biophysics Unit<br>IISc,Bangalore-560012<br>Karnataka<br>Ph. no.-22932611<br><br><br><br>--<br>This message has been scanned for viruses and<br>dangerous content by MailScanner, and is
<br>believed to be clean.<br><br>_______________________________________________<br>gmx-users mailing list&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;<a href="mailto:gmx-users@gromacs.org">gmx-users@gromacs.org</a><br><a href="http://www.gromacs.org/mailman/listinfo/gmx-users">
http://www.gromacs.org/mailman/listinfo/gmx-users</a><br>Please search the archive at <a href="http://www.gromacs.org/search">http://www.gromacs.org/search</a> before posting!<br>Please don&#39;t post (un)subscribe requests to the list. Use the
<br>www interface or send it to <a href="mailto:gmx-users-request@gromacs.org">gmx-users-request@gromacs.org</a>.<br>Can&#39;t post? Read <a href="http://www.gromacs.org/mailing_lists/users.php">http://www.gromacs.org/mailing_lists/users.php
</a><br></blockquote></div><br><br clear="all"><br>-- <br>Tsjerk A. Wassenaar, Ph.D.<br>Junior UD (post-doc)<br>Biomolecular NMR, Bijvoet Center<br>Utrecht University<br>Padualaan 8 <br>3584 CH Utrecht<br>The Netherlands<br>
P: +31-30-2539931&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;<br>F: +31-30-2537623