Dear all,<br><br>I wish to calculate the density profile of a lipid bilayer i.e the electron density and this is how I am using the g_density command:<br><br>g_density -f final.trr -s final.tpr -ei electrons.dat -o density.xvg -ed -symm<br><br>where electrons.dat contains # of electrons information for each and every atomtype defined in the system e.g.<br>C2A = 6<br>NTM = 7<br>OA&nbsp;&nbsp; = 8 etc....<br><br>However it reports electron density for 50bins (setup by -sl) which ranges from 0 to 50. However I want it to vary from, -30 to +30. <br><br>Another point is, I want the density profile separately for P, N, acyl, water etc. Should I define a separate electrons.dat for this purpose? <br><br>Kindly suggest me as to how should I proceed,<br>eagerly waiting for your reply,<br>Priyanka S...<br><p>&#32;
      <hr size=1>Looking for a deal? <a href="http://us.rd.yahoo.com/evt=47094/*http://farechase.yahoo.com/;_ylc=X3oDMTFicDJoNDllBF9TAzk3NDA3NTg5BHBvcwMxMwRzZWMDZ3JvdXBzBHNsawNlbWFpbC1uY20-">Find great prices on flights and hotels</a> with Yahoo! FareChase.