<html>
<head>
<style>
.hmmessage P
{
margin:0px;
padding:0px
}
body.hmmessage
{
FONT-SIZE: 10pt;
FONT-FAMILY:Tahoma
}
</style>
</head>
<body class='hmmessage'><div style="text-align: left;">Dear sir,<br><br>I am trying to fit two confomations of a protein using g_confrms command. The program&nbsp; is giving the result but when I am trying to use two different proteins it is giving the following error.<br><br><br>command: g_confrms -f1 1prg.pdb -f2 speptide.pdb -o fit.pdb<br>-------<br>Then it asked to "Select group from first structure" and "Select group from second structure", then I gave "0" (System) for both.<br><br>At the end it has shown the following error:<br>"-------------------------------------------------------<br>Program g_confrms, VERSION 3.3.1<br>Source code file: gmx_confrms.c, line: 467<br><br>Fatal error:<br>You selected groups with differen number of atoms.<br><br>-------------------------------------------------------"<br><br>While in the manual it is mentioned that we can use PDB files with different atoms.<br><br>Kindly help me regarding this.<br><br>Regards<br>Harpreet Singh<br><br><br></div><br /><hr />Climb to the top of the charts!  Play Star Shuffle:  the word scramble challenge with star power. <a href='http://club.live.com/star_shuffle.aspx?icid=starshuffle_wlmailtextlink_oct' target='_new'>Play Now!</a></body>
</html>