<P>
&nbsp; Thanks Mark,<BR>
&nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; I could do it following your suggestion.<BR>
&nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; Sarbani<BR>
<BR>
<BR>
On Wed, 24 Oct 2007 Mark Abraham wrote :<BR>
&gt;sarbani chattopadhyay wrote:<BR>
&gt;&gt;&nbsp;  hi,<BR>
&gt;&gt;&nbsp; &nbsp;  I want to select two groups in the index file, one group consisting of only the <BR>
aromatic<BR>
&gt;&gt;ring of phenylalanine and the other group consisting of only the alpha carbon.<BR>
&gt;&gt;I want to&nbsp; know the way to use the make_ndx command for this.<BR>
&gt;<BR>
&gt;After entering make_ndx, you can use &quot;h&lt;RETURN&gt;&quot; to get some primitive help.<BR>
&gt;<BR>
&gt;In this case, you can most quickly solve your problem by hand-editing. See http://<BR>
wiki.gromacs.org/index.php/Index_File<BR>
&gt;<BR>
&gt;Mark<BR>
&gt;_______________________________________________<BR>
&gt;gmx-users mailing list&nbsp; &nbsp; gmx-users@gromacs.org<BR>
&gt;http://www.gromacs.org/mailman/listinfo/gmx-users<BR>
&gt;Please search the archive at http://www.gromacs.org/search before posting!<BR>
&gt;Please don't post (un)subscribe requests to the list. Use the www interface or send it to <BR>
gmx-users-request@gromacs.org.<BR>
&gt;Can't post? Read http://www.gromacs.org/mailing_lists/users.php<BR>

</P>
<br><br>
<Table border=0 Width=644 Height=57 cellspacing=0 cellpadding=0 style='font-family:Verdana;font-size:11px;line-height:15px;'><TR><td><a href='http://adworks.rediff.com/cgi-bin/AdWorks/click.cgi/www.rediff.com/signature-home.htm/1050715198@Middle5/1501995_1495158/1501424/1?PARTNER=3&OAS_QUERY=null target=new '><img src =http://imadworks.rediff.com/cgi-bin/AdWorks/adimage.cgi/1501995_1495158/creative_1501424.gif  alt='Garnier'  border=0></a></td></TR></Table>