Hi Gromacs users:<br><br>As described in the PDF of Gromacs documentation version 3.3.1 (pp 160-161),&nbsp; with g_rdf we can compute the radial distribution function between particles of type A and B, where A is the reference group.
<br>I am not clear on how g_rdf computes the volume in the particle density of type B. &nbsp; The particle density of type B is represented by &lt;ro_B&gt;_local in the documentation, which I understand to be&nbsp; N/V, where N is the total number of particles of type B, and V is the volume of the entire box.
<br>Is this the case?<br><br>Any help is appreciated.&nbsp; <br><br>Thanks,<br><br>Grace<br>