<div>Sir</div>  <div>I installed the makehole program as given in instructions, by making a separate copy of gromacs and then added the makehole tar file to it. Then followed the normal steps for installation.</div>  <div>&nbsp;</div>  <div>But when i set the mdp file as given in tutorial and try to give the grompp command, it does not identify the various parameters of&nbsp; the mdp file.</div>  <div>&nbsp;</div>  <div>Please help. Is it that&nbsp; I am using the normal grompp command and not the one for makehole??</div>  <div>&nbsp;</div>  <div>When i make a separate copy of gromacs and then install the makehole package, do its commands add on to the existing gromacs&nbsp;folder?</div>  <div>&nbsp;</div>  <div>regards</div>  <div>nur</div><p>&#32;


      <!--1--><hr size=1></hr> Bollywood, fun, friendship, sports and more. You name it, <a href="http://in.rd.yahoo.com/tagline_groups_1/*http://in.promos.yahoo.com/groups"> we have it.</a>