Hi Maria,<br><br>try gmxcheck<br><br>Tsjerk<br><br><div class="gmail_quote">On Nov 21, 2007 10:25 AM, maria goranovic &lt;<a href="mailto:mariagoranovic@gmail.com">mariagoranovic@gmail.com</a>&gt; wrote:<br><blockquote class="gmail_quote" style="border-left: 1px solid rgb(204, 204, 204); margin: 0pt 0pt 0pt 0.8ex; padding-left: 1ex;">

Hi, Is there a utility which can output basic trajectory information like: - number of frames - frequency of frame writing I tried using trjcat on my trajectory which is 27 frames, each frame written every 2 ps.

<br>% trjcat -f temp.trr<br><br>This is the output that I get<br>################################<br>Summary of files and start times used:<br> &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp;File &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp;Start time &nbsp; &nbsp; &nbsp; Time step<br>---------------------------------------------------------

<br> &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; temp.trr &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp;0.000 ps &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp;2.000 ps<br><br>Back Off! I just backed up trajout.xtc to ./#trajout.xtc.1#<br>Reading frame &nbsp; &nbsp; &nbsp; 0 time &nbsp; &nbsp;0.000<br>lasttime -12345<br>Continue writing frames from temp.trr

t=0 ps, frame=0 Reading frame &nbsp; &nbsp; &nbsp;20 time &nbsp; 40.000 &nbsp; &nbsp;-&gt; &nbsp;frame &nbsp; &nbsp; 20 time &nbsp; 40.000 ps Last frame written was 27, time 54.000004 ps ################################ Questions: 1. Why does the last but one line in the output read the way it does ?

<br>2. how can i prevent an output, and get only trajectory information ?<br><br><br>Thank you<br><br>-Maria<br><br>--<br>Maria G.<br>Technical University of Denmark<br>Copenhagen<br>_______________________________________________

<br>gmx-users mailing list &nbsp; &nbsp;<a href="mailto:gmx-users@gromacs.org">gmx-users@gromacs.org</a><br><a href="http://www.gromacs.org/mailman/listinfo/gmx-users" target="_blank">http://www.gromacs.org/mailman/listinfo/gmx-users

</a><br>Please search the archive at <a href="http://www.gromacs.org/search" target="_blank">http://www.gromacs.org/search</a> before posting!<br>Please don&#39;t post (un)subscribe requests to the list. Use the<br>www interface or send it to 

<a href="mailto:gmx-users-request@gromacs.org">gmx-users-request@gromacs.org</a>.<br>Can&#39;t post? Read <a href="http://www.gromacs.org/mailing_lists/users.php" target="_blank">http://www.gromacs.org/mailing_lists/users.php

</a><br></blockquote></div><br><br clear="all"><br>-- <br>Tsjerk A. Wassenaar, Ph.D.<br>Junior UD (post-doc)<br>Biomolecular NMR, Bijvoet Center<br>Utrecht University<br>Padualaan 8 <br>3584 CH Utrecht<br>The Netherlands<br>

P: +31-30-2539931 &nbsp; &nbsp;<br>F: +31-30-2537623