<P>
<BR>
&nbsp; <BR>
<BR>
The top file is <BR>
#include &quot;ffgmx.itp&quot;<BR>
#include &quot;tip5P.itp&quot;<BR>
&nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp;  <BR>
[ system ]<BR>
Pure water<BR>
&nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp;  <BR>
[ molecules ]<BR>
SOL 258<BR>
-------------------------------------<BR>
<BR>
<BR>
The itp file is<BR>
[ moleculetype ]<BR>
; molname&nbsp;  nrexcl<BR>
SOL&nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp;  2<BR>
&nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp;  <BR>
[ atoms ]<BR>
; id&nbsp; &nbsp; at type res nr&nbsp; residu name&nbsp;  at name&nbsp; &nbsp; cg nr&nbsp;  charge<BR>
#ifdef _FF_OPLS<BR>
&nbsp;  1&nbsp; &nbsp;  opls_118&nbsp; &nbsp; 1&nbsp; &nbsp; SOL&nbsp; &nbsp; &nbsp; OW&nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp;  1&nbsp; &nbsp; &nbsp;  0<BR>
&nbsp;  2&nbsp; &nbsp;  opls_119&nbsp; &nbsp; 1&nbsp; &nbsp; SOL&nbsp; &nbsp; &nbsp; HW1&nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; 1&nbsp; &nbsp; &nbsp;  0.24<BR>
&nbsp;  3&nbsp; &nbsp;  opls_119&nbsp; &nbsp; 1&nbsp; &nbsp; SOL&nbsp; &nbsp; &nbsp; HW2&nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; 1&nbsp; &nbsp; &nbsp;  0.241<BR>
&nbsp;  4&nbsp; &nbsp;  opls_120&nbsp; &nbsp; 1&nbsp; &nbsp; SOL&nbsp; &nbsp; &nbsp; LP1&nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; 1&nbsp; &nbsp; &nbsp; -0.241<BR>
&nbsp;  5&nbsp; &nbsp;  opls_120&nbsp; &nbsp; 1&nbsp; &nbsp; SOL&nbsp; &nbsp; &nbsp; LP2&nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; 1&nbsp; &nbsp; &nbsp; -0.241<BR>
&nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp;  <BR>
[ settles ]<BR>
; i&nbsp; &nbsp;  funct&nbsp;  doh&nbsp; &nbsp;  dhh<BR>
1&nbsp; &nbsp; &nbsp;  1&nbsp; &nbsp; &nbsp;  0.09572 0.15139<BR>
&nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp;  <BR>
[ dummies3 ]<BR>
; The position of the dummy is computed as follows:<BR>
;<BR>
; The distance from OW to OL is 0.07 nm, the geometry is tetrahedral<BR>
; (109.47 deg)<BR>
; Therefore, a =3D b =3D 0.07 * cos (109.47/2) / | xOH1 + xOH2 |<BR>
;&nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; c =3D 0.07 * sin (109.47/2) / | xOH1 X xOH2 |<BR>
;&nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp;  =20<BR>
;<BR>
; Using | xOH1 X xOH2 | =3D | xOH1 | | xOH2 | sin (H1-O-H2)<BR>
;&nbsp; &nbsp; &nbsp;  | xOH1 + xOH2 | =3D 2 | xOH1 | cos (H1-O-H2)<BR>
; Dummy pos x4 =3D x1 + a*x21 + b*x31 + c*(x21 X x31)<BR>
&nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp;  <BR>
; Dummy from&nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; funct&nbsp;  a&nbsp; &nbsp; &nbsp;  b&nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp;  c<BR>
4&nbsp; &nbsp; &nbsp;  1&nbsp; &nbsp; &nbsp;  2&nbsp; &nbsp; &nbsp;  3&nbsp; &nbsp; &nbsp;  4&nbsp; &nbsp; &nbsp;  -0.344908&nbsp; -0.344908&nbsp; -6.4437903493<BR>
5&nbsp; &nbsp; &nbsp;  1&nbsp; &nbsp; &nbsp;  2&nbsp; &nbsp; &nbsp;  3&nbsp; &nbsp; &nbsp;  4&nbsp; &nbsp; &nbsp;  -0.344908&nbsp; -0.344908&nbsp;  6.4437903493<BR>
&nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp;  <BR>
[ exclusions ]<BR>
1&nbsp; &nbsp; &nbsp;  2&nbsp; &nbsp; &nbsp;  3&nbsp; &nbsp; &nbsp;  4&nbsp; &nbsp; &nbsp;  5<BR>
2&nbsp; &nbsp; &nbsp;  1&nbsp; &nbsp; &nbsp;  3&nbsp; &nbsp; &nbsp;  4&nbsp; &nbsp; &nbsp;  5<BR>
3&nbsp; &nbsp; &nbsp;  1&nbsp; &nbsp; &nbsp;  2&nbsp; &nbsp; &nbsp;  4&nbsp; &nbsp; &nbsp;  5<BR>
4&nbsp; &nbsp; &nbsp;  1&nbsp; &nbsp; &nbsp;  2&nbsp; &nbsp; &nbsp;  3&nbsp; &nbsp; &nbsp;  5<BR>
5&nbsp; &nbsp; &nbsp;  1&nbsp; &nbsp; &nbsp;  2&nbsp; &nbsp; &nbsp;  3&nbsp; &nbsp; &nbsp;  4<BR>
#endif<BR>
----------------------------------------------------------------------------<BR>
<BR>
Can anyone help me in this regard?<BR>
<BR>
<BR>
Jestin Mandumpal
</P>
<br><br>
<Table border=0 Width=644 Height=57 cellspacing=0 cellpadding=0 style='font-family:Verdana;font-size:11px;line-height:15px;'><TR><td><a href='http://adworks.rediff.com/cgi-bin/AdWorks/click.cgi/www.rediff.com/signature-home.htm/1050715198@Middle5/1846186_1839156/1845568/1?PARTNER=3&OAS_QUERY=null target=new '><img src =http://imadworks.rediff.com/cgi-bin/AdWorks/adimage.cgi/1846186_1839156/creative_1845568.gif  alt='mobiles'  border=0></a></td></TR></Table>