<div>Hi,</div>  <div>Could anyone tell me how to parameterize a new molecule for using it with OPLS (basic principles). What a .pdb file should look like and what .mdp variables are specificaly related to OPLS?</div>  <div>&nbsp;</div>  <div>Thank you in advance</div>  <div>&nbsp;</div>  <div>Egidijus</div><p>&#32;

      <hr size=1>Never miss a thing.  <a href="http://us.rd.yahoo.com/evt=51438/*http://www.yahoo.com/r/hs"> Make Yahoo your homepage.</a>