<div>Dear all, could anybody know how to tackle the problem? I have such pdb file</div>  <div>&nbsp;</div><FONT size=1>  <div>HETATM 1 CB1 DRG 1 -5.058 1.624 -0.274 1.00 C</div>  <div>HETATM 2 HB11 DRG 1 -4.785 2.632 0.071 1.00 H</div>  <div>HETATM 3 HB12 DRG 1 -6.149 1.562 -0.397 1.00 H</div>  <div>HETATM 4 HB13 DRG 1 -4.568 1.422 -1.238 1.00 H</div>  <div>HETATM 5 CG1 DRG 1 -4.605 0.597 0.750 1.00 C</div>  <div>HETATM 6 HG11 DRG 1 -3.935 1.170 1.408 1.00 H</div>  <div>HETATM 7 HG12 DRG 1 -5.530 0.351 1.292 1.00 H</div>  <div>HETATM 8 SA DRG 1 -3.772 -0.918 -0.015 1.00 S</div>  <div>HETATM 9 SB DRG 1 -1.851 -0.088 -0.732 1.00 S</div>  <div>HETATM 10 CG2 DRG 1 -0.742 -0.380 0.787 1.00 C</div>  <div>HETATM 11 HG21 DRG 1 -0.977 0.268 1.645 1.00 H</div>  <div>HETATM 12 HG22 DRG 1 -0.702 -1.428 1.118 1.00 H</div>  <div>HETATM 13 C1 DRG 1 0.673 -0.045 0.446 1.00 C</div>  <div>HETATM 14 C2 DRG 1 1.694 -1.104 0.050 1.00 C</div>  <div>HETATM 15 CB2 DRG 1 1.976 -2.108 1.178 1.00
 C</div>  <div>HETATM 16 HB21 DRG 1 1.103 -2.166 1.844 1.00 H</div>  <div>HETATM 17 HB22 DRG 1 2.854 -1.777 1.752 1.00 H</div>  <div>HETATM 18 HB23 DRG 1 2.173 -3.100 0.745 1.00 H</div>  <div>HETATM 19 CB3 DRG 1 1.344 -1.842 -1.250 1.00 C</div>  <div>HETATM 20 HB31 DRG 1 0.469 -1.367 -1.717 1.00 H</div>  <div>HETATM 21 HB32 DRG 1 1.113 -2.894 -1.024 1.00 H</div>  <div>HETATM 22 HB33 DRG 1 2.199 -1.794 -1.940 1.00 H</div>  <div>HETATM 23 CA DRG 1 1.203 1.171 0.459 1.00 C</div>  <div>HETATM 24 HA DRG 1 0.585 2.037 0.737 1.00 H</div>  <div>HETATM 25 C3 DRG 1 2.660 1.200 0.069 1.00 C</div>  <div>HETATM 26 CB4 DRG 1 2.912 1.990 -1.222 1.00 C</div>  <div>HETATM 27 HB41 DRG 1 2.761 3.063 -1.031 1.00 H</div>  <div>HETATM 28 HB42 DRG 1 2.211 1.654 -2.000 1.00 H</div>  <div>HETATM 29 HB43 DRG 1 3.945 1.819 -1.560 1.00 H</div>  <div>HETATM 30 CB5 DRG 1 3.566 1.706 1.199 1.00 C</div>  <div>HETATM 31 HB51 DRG 1 3.133 2.618 1.636 1.00 H</div>  <div>HETATM 32 HB52 DRG 1 4.564 1.931 0.795
 1.00 H</div>  <div>HETATM 33 HB53 DRG 1 3.650 0.932 1.976 1.00 H</div>  <div>HETATM 34 N DRG 1 2.872 -0.241 -0.157 1.00 N</div>  <div>HETATM 35 O DRG 1 4.010 -0.715 -0.511 1.00 O</div>  <div>CONECT 1 5 2 3 4</div>  <div>CONECT 2 1</div>  <div>CONECT 3 1</div>  <div>CONECT 4 1</div>  <div>CONECT 5 1 8 6 7</div>  <div>CONECT 6 5</div>  <div>CONECT 7 5</div>  <div>CONECT 8 5 9</div>  <div>CONECT 9 8 10</div>  <div>CONECT 10 9 13 11 12</div>  <div>CONECT 11 10</div>  <div>CONECT 12 10</div>  <div>CONECT 13 10 14 23</div>  <div>CONECT 14 13 15 19 34</div>  <div>CONECT 15 14 16 17 18</div>  <div>CONECT 16 15</div>  <div>CONECT 17 15</div>  <div>CONECT 18 15</div>  <div>CONECT 19 14 20 21 22</div>  <div>CONECT 20 19</div>  <div>CONECT 21 19</div>  <div>CONECT 22 19</div>  <div>CONECT 23 13 25 24</div>  <div>CONECT 24 23</div>  <div>CONECT 25 23 26 30 34</div>  <div>CONECT 26 25 27 28 29</div>  <div>CONECT 27 26</div>  <div>CONECT 28 26</div>  <div>CONECT 29 26</div>  <div>CONECT
 30 25 31 32 33</div>  <div>CONECT 31 30</div>  <div>CONECT 32 30</div>  <div>CONECT 33 30</div>  <div>CONECT 34 14 25 35</div>  <div>CONECT 35 34</div>  <div>END</div></FONT>  <div>&nbsp;</div>  <div>and I put at the end of my rtp file this residue</div>  <div>&nbsp;</div><FONT size=1><FONT size=1>  <div>[ DRG ]</div>  <div>[ atoms ]</div>  <div>CB1 opls_135 -0.487 1</div>  <div>HB11 opls_140 0.181 1</div>  <div>HB12 opls_140 0.200 1</div>  <div>HB13 opls_140 0.211 1</div>  <div>CG1 opls_157 -0.603 1</div>  <div>HG11 opls_140 0.226 1</div>  <div>HG12 opls_140 0.221 1</div>  <div>SA opls_202 0.049 1</div>  <div>SB opls_202 0.089 1</div>  <div>CG2 opls_157 -0.720 1</div>  <div>HG21 opls_140 0.236 1</div>  <div>HG22 opls_140 0.251 1</div>  <div>C1 opls_145 0.176 1</div>  <div>C2 opls_145 0.004 1</div>  <div>CB2 opls_135 -0.462 1</div>  <div>HB21 opls_140 0.207 1</div>  <div>HB22 opls_140 0.174 1</div>  <div>HB23 opls_140 0.181 1</div>  <div>CB3 opls_135 -0.456 1</div> 
 <div>HB31 opls_140 0.192 1</div>  <div>HB32 opls_140 0.189 1</div>  <div>HB33 opls_140 0.199 1</div>  <div>CA opls_224B -0.092 1</div>  <div>HA opls_140 0.164 1</div>  <div>C3 opls_145 0.029 1</div>  <div>CB4 opls_135 -0.457 1</div>  <div>HB41 opls_140 0.173 1</div>  <div>HB42 opls_140 0.187 1</div>  <div>HB43 opls_140 0.201 1</div>  <div>CB5 opls_135 -0.458 1</div>  <div>HB51 opls_140 0.173 1</div>  <div>HB52 opls_140 0.202 1</div>  <div>HB53 opls_140 0.181 1</div>  <div>N opls_238 -0.229 1</div>  <div>O opls_236 -0.332 1</div>  <div>[ bonds ]</div>  <div>CB1 HB11 </div>  <div>CB1 HB12</div>  <div>CB1 HB13</div>  <div>CB1 CG1</div>  <div>CG1 HG11</div>  <div>CG1 HG12</div>  <div>CG1 SA</div>  <div>SA SB</div>  <div>SB CG2</div>  <div>CG2 HG21</div>  <div>CG2 HG22</div>  <div>CG2 C1</div>  <div>C1 C2</div>  <div>C2 CB2</div>  <div>C2 CB3</div>  <div>C2 N</div>  <div>CB2 HB21</div>  <div>CB2 HB22</div>  <div>CB2 HB23</div>  <div>CB3 HB31</div>  <div>CB3 HB32</div>  <div>CB3
 HB33</div>  <div>N O</div>  <div>N C3</div>  <div>C3 CB4</div>  <div>C3 CB5</div>  <div>C3 CA</div>  <div>CB4 HB41</div>  <div>CB4 HB42</div>  <div>CB4 HB43 </div>  <div>CB5 HB51</div>  <div>CB5 HB52</div>  <div>CB5 HB53</div>  <div>C1 CA</div>  <div>CA HA</div>  <div></div>  <div>[ impropers ]</div>  <div>CA C2 C1 CG2 improper_Z_CA_X_Y </div>  <div>C1 C3 CA HA improper_Z_CA_X_Y </div>  <div>C2 C3 N O improper_Z_N_X_Y </div>  <div>C1 N C2 CB2 improper_O_C_X_Y </div>  <div>CA N C3 CB4 improper_O_C_X_Y </div>  <div></FONT></FONT>&nbsp;</div>  <div>I've got this error</div>  <div>&nbsp;</div>  <div>-------------------------------------------------------<BR>Program pdb2gmx_d, VERSION 3.3.2<BR>Source code file: resall.c, line: 289</div>  <div>Fatal error:<BR>in .rtp file at line:</div>  <div><BR>-------------------------------------------------------<BR></div><FONT size=1>  <div>Something is&nbsp;wrong with my rtp, but I have no clue what (maybe impropers or bonds). Thank you
 in advance</div></FONT><p>&#32;
      <hr size=1>Looking for last minute shopping deals? <a href="http://us.rd.yahoo.com/evt=51734/*http://tools.search.yahoo.com/newsearch/category.php?category=shopping"> 
Find them fast with Yahoo! Search.</a>