<!DOCTYPE html PUBLIC "-//W3C//DTD HTML 4.01 Transitional//EN">
<html>
<head>
  <meta content="text/html;charset=ISO-8859-1" http-equiv="Content-Type">
</head>
<body bgcolor="#ffffff" text="#000000">
Hi Subhrangshu,<br>
There's usually not much point in adding OH- ions since they're not
regular ions that diffuse in the system, but rather form via
decomposition of water. If you need to study a system with those ions
try using ab initio MD.<br>
Ran.<br>
<br>
Subhrangshu Supakar wrote:
<blockquote
 cite="mid28ab3fc70801280047l4819d78ep23949c514c701a73@mail.gmail.com"
 type="cite">Hi all,<br>
How can I add OH- ions to my system (NA+ water OH-)?<br>
How can I create the topology and cal culate the partial charges?<br>
  <br>
Thanks in advance,<br>
Subhrangshu Supakar<br>
WBUT, Kolkata, India.<br>
  <pre wrap="">
<hr size="4" width="90%">
_______________________________________________
gmx-users mailing list    <a class="moz-txt-link-abbreviated" href="mailto:gmx-users@gromacs.org">gmx-users@gromacs.org</a>
<a class="moz-txt-link-freetext" href="http://www.gromacs.org/mailman/listinfo/gmx-users">http://www.gromacs.org/mailman/listinfo/gmx-users</a>
Please search the archive at <a class="moz-txt-link-freetext" href="http://www.gromacs.org/search">http://www.gromacs.org/search</a> before posting!
Please don't post (un)subscribe requests to the list. Use the 
www interface or send it to <a class="moz-txt-link-abbreviated" href="mailto:gmx-users-request@gromacs.org">gmx-users-request@gromacs.org</a>.
Can't post? Read <a class="moz-txt-link-freetext" href="http://www.gromacs.org/mailing_lists/users.php">http://www.gromacs.org/mailing_lists/users.php</a></pre>
</blockquote>
<br>
</body>
</html>