Dear All,<br><br>I am trying to simulate tetrahydrofuran molecules with 3 layer gold surface.<br>However, I would like to constrain my system in Z direction. I have tried to do that by increasing the box size in z direction by 3 fold but I still found few molecules coming toward other side. Is there any other way to implement the boundary conditions only in XY plane? or to have a repulsive wall potential at some z?<br><br>And is it possible to place the system at the z=0 plane instead of having it at the center of simulation box either by using editconf or some other?<br><br>Many Thanks<br>Rohit<br><p>&#32;


      <!--8--><hr size=1></hr> Share files, take polls, and discuss your passions - all under one roof. <a href="http://in.rd.yahoo.com/tagline_groups_8/*http://in.promos.yahoo.com/groups"> Click here.</a>