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<div class=Section1>

<p class=MsoNormal><font size=2 face="Times New Roman"><span style='font-size:
10.0pt'>Dear all,<o:p></o:p></span></font></p>

<p class=MsoNormal><font size=2 face="Times New Roman"><span style='font-size:
10.0pt'><o:p>&nbsp;</o:p></span></font></p>

<p class=MsoNormal><font size=2 face="Times New Roman"><span style='font-size:
10.0pt'>I wonder if the drift velocity has been removed from calculating the
temperature for a non-equilibrium MD in which a directional movement for a
group exists due to external force applied. <o:p></o:p></span></font></p>

<p class=MsoNormal><font size=2 face="Times New Roman"><span style='font-size:
10.0pt'><o:p>&nbsp;</o:p></span></font></p>

<p class=MsoNormal><font size=2 face="Times New Roman"><span style='font-size:
10.0pt'>One paper, entitled &#8220;Why are carbon nanotubes fast transporters
of water?&#8221; (Joseph and Aluru, Nano Letters, web release version in Feb.
2008), mentioned that &#8220;the mean axial velocity of water was subtracted
from the axial component of the velocity of each water molecule as implemented
in ref 20.&#8221; Here the ref 20 is the one (Lindahl et al., Gromacs 3.0: a
package for molecular simulation and trajectory analysis. J Mol Model, 2001, 7:306-317).
Unfortunately I did not find such information in ref 20. <o:p></o:p></span></font></p>

<p class=MsoNormal><font size=2 face="Times New Roman"><span style='font-size:
10.0pt'><o:p>&nbsp;</o:p></span></font></p>

<p class=MsoNormal><font size=2 face="Times New Roman"><span style='font-size:
10.0pt'>Anyone can tell me the clear answer on this?<o:p></o:p></span></font></p>

<p class=MsoNormal><font size=2 face="Times New Roman"><span style='font-size:
10.0pt'><o:p>&nbsp;</o:p></span></font></p>

<p class=MsoNormal><font size=2 face=Arial><span style='font-size:10.0pt;
font-family:Arial'>Thanks,</span></font><o:p></o:p></p>

<p class=MsoNormal><font size=2 face=Arial><span style='font-size:10.0pt;
font-family:Arial'>Zhongqiao</span></font><o:p></o:p></p>

<p class=MsoNormal><font size=3 face="Times New Roman"><span style='font-size:
12.0pt'><o:p>&nbsp;</o:p></span></font></p>

</div>

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