Hi,<br>I have added missing atoms to my pdb file through servers of WHATIF,when I use the force field option then the following output comes in shell console:<br><span style="font-weight: bold;">Fatal error:</span><br style="font-weight: bold;"><span style="font-weight: bold;">Residue 'GTP' not found in residue topology database</span><br style="font-weight: bold;">and the following files are created:<br><span style="font-weight: bold;">&nbsp;2a5f.top&nbsp; 2a5f_A.itp&nbsp; 2a5f_B.itp&nbsp; posre_A.itp&nbsp; posre_B.itp<br></span>Please guide me so that GTP is added to PDB.Further which force field and box will be better for my simulation of enzyme-Protein GTP complex?<br>regards,<BR><BR><STRONG><FONT color=#007f40>SYED LAL BADSHAH <BR>M.Phil Scholar <BR>NCE in Physical Chemistry, <BR>University of Peshawar. <BR>NWFP,Pakistan. <BR>Cell # 03349060632.</FONT></STRONG><p>&#32;Send instant messages to your online friends http://uk.messenger.yahoo.com