Hi,<br>I am new to GROMACS.Currently I am working on a protein.For minimization I prepare file and when I gave the command in the shell the following output comes:<br><span style="font-weight: bold;">Fatal error:</span><br style="font-weight: bold;"><span style="font-weight: bold;">number of coordinates in coordinate file (2a5f_b4ion.pdb, 40183)</span><br style="font-weight: bold;"><span style="font-weight: bold;">&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; does not match topology (2a5f.top, 40612)</span><br style="font-weight: bold;">Please guide me what path I should follow to correct it.<br>Regards,<br>lal badshah<br><p>&#32;Send instant messages to your online friends http://uk.messenger.yahoo.com