Dear all,<br>I am trying to do Energy Minimization of a protein.But it gives the following error:<br>ERROR: invalid enum 'cut-&#65533;&#65533;off' for variable vdw-type, using 'Cut-off'<br>Next time use one of: 'Cut-off' 'Switch' 'Shift' 'User' 'Encad-shift'<br><br>Back Off! I just backed up mdout.mdp to ./#mdout.mdp.1#<br>checking input for internal consistency...<br>calling /usr/bin/cpp &#65533;&#65533; the c pre&#65533;&#65533;processor...<br>cpp: too many input files<br>cpp exit code: 256<br>Tried to execute: '/usr/bin/cpp &#65533;&#65533; the c pre&#65533;&#65533;processor -I/usr/share/gromacs/top -I/usr/share/gromacs/top &#65533;&#65533;-DPOSRES_SPC 2a5f.top &gt; gromppGMSvC5'<br>The '/usr/bin/cpp &#65533;&#65533; the c pre&#65533;&#65533;processor' command is defined in the .mdp file<br>processing topology...<br>processing coordinates...<br>-------------------------------------------------------<br>Program grompp, VERSION 3.3.1<br>Source code file: grompp.c, line:
 448<br><br>Fatal error:<br>number of coordinates in coordinate file (2a5f_b4ion.gro, 23644)<br>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; does not match topology (2a5f.top, 0)<br>What Should I do and how can I remove the input files, as mentioned above that<br>cpp: too many input files.<br>Regards,<br><BR><BR><STRONG><FONT color=#007f40>SYED LAL BADSHAH <BR>M.Phil Scholar <BR>NCE in Physical Chemistry, <BR>University of Peshawar. <BR>NWFP,Pakistan. <BR>Cell # 03349060632.</FONT></STRONG><p>&#32;Send instant messages to your online friends http://uk.messenger.yahoo.com