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Diego Enry wrote:
<blockquote
 cite="mideae4cfe70803060924sbf1e9d0g615147e326f39029@mail.gmail.com"
 type="cite">
  <pre wrap="">On Thu, Mar 6, 2008 at 1:26 PM, Ricardo Soares <a class="moz-txt-link-rfc2396E" href="mailto:rsoares@fcfrp.usp.br">&lt;rsoares@fcfrp.usp.br&gt;</a> wrote:
  </pre>
  <blockquote type="cite">
    <pre wrap="">Hello everyone,

 I have 3 available computers for my simulations; two of them are dual
 core. Which is better for me: run one simulation each independently or
 parallelize them all?

    </pre>
  </blockquote>
  <pre wrap=""><!---->
In theory, if the simulations are independent it would be faster to
run them independently, but you actually doubles the speed if you run
in parallel in a SINGLE dual core machine.
I would not recommend you to parallelize it to more than one machine
if your network fabric is Gigabit Ethernet... unless you are really in
a hurry to finish a single simulation.

have fun !

  </pre>
  <blockquote type="cite">
    <pre wrap=""> Thanks!

 Ricardo.

 --
 ___________________________________________________________

 Ricardo Oliveira dos Santos Soares
 Post-graduation Student in Biological Physics
 University of Sao Paulo - USP
 Faculty of Farmaceutical Sciences of Ribeirao Preto - FCFRP
 Phone: 55 (16) 3602-4840
 Curriculum Lattes - <a class="moz-txt-link-freetext" href="http://lattes.cnpq.br/0777038258459931">http://lattes.cnpq.br/0777038258459931</a>
 ___________________________________________________________

 _______________________________________________
 gmx-users mailing list    <a class="moz-txt-link-abbreviated" href="mailto:gmx-users@gromacs.org">gmx-users@gromacs.org</a>
 <a class="moz-txt-link-freetext" href="http://www.gromacs.org/mailman/listinfo/gmx-users">http://www.gromacs.org/mailman/listinfo/gmx-users</a>
 Please search the archive at <a class="moz-txt-link-freetext" href="http://www.gromacs.org/search">http://www.gromacs.org/search</a> before posting!
 Please don't post (un)subscribe requests to the list. Use the
 www interface or send it to <a class="moz-txt-link-abbreviated" href="mailto:gmx-users-request@gromacs.org">gmx-users-request@gromacs.org</a>.
 Can't post? Read <a class="moz-txt-link-freetext" href="http://www.gromacs.org/mailing_lists/users.php">http://www.gromacs.org/mailing_lists/users.php</a>

    </pre>
  </blockquote>
  <pre wrap=""><!---->


  </pre>
</blockquote>
Hello Diego,<br>
<br>
Thanks for the tips. Just one more thing, what is the deal with the
Gigabit Ethernet concerning this topic?<br>
<br>
Regards,<br>
<br>
Ricardo.<br>
<br>
<pre class="moz-signature" cols="72">-- 
___________________________________________________________

Ricardo Oliveira dos Santos Soares
Post-graduation Student in Biological Physics
University of Sao Paulo - USP
Faculty of Farmaceutical Sciences of Ribeirao Preto - FCFRP
Phone: 55 (16) 3602-4840
Curriculum Lattes - <a class="moz-txt-link-freetext" href="http://lattes.cnpq.br/0777038258459931">http://lattes.cnpq.br/0777038258459931</a>
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