<P>
&nbsp; <BR>
 hi to all<BR>
i am currently using GROMACS to run a simulation of gases diffusion&nbsp; that includes hydrogen and oxygen gas .<BR>
I am stuck at the part in which I have to replace water with oxygen gas using genbox command.<BR>
I could no fond any .gro file for oxygen or hydrogen gas<BR>
How I can include the gas in my simulation<BR>
can any1 provide me any paper relating the use of gromacs for gases diffusion simulation<BR>
Thanking You<BR>
Sincerely<BR>
Vipul Gupta <BR>
IIDS<BR>
University of Allahabad<BR>
India&nbsp; 
</P>
<br><br>
<Table border=0 Width=644 Height=57 cellspacing=0 cellpadding=0 style='font-family:Verdana;font-size:11px;line-height:15px;'><TR><td><a href='http://adworks.rediff.com/cgi-bin/AdWorks/click.cgi/www.rediff.com/signature-home.htm/1050715198@Middle5/2066359_2058993/2066443/1?PARTNER=3&OAS_QUERY=null' target=new ><img src ='http://imadworks.rediff.com/cgi-bin/AdWorks/adimage.cgi/2066359_2058993/creative_2066443.gif'  alt='Honda'  border=0></a></td></TR></Table>