Hi gmx-users, <br>I used deprecated FF for protein in water simulation and ran minimisation, equilibration and production. After finishing protein inserted into POPC bilayer, which has ffgmx.itp. <br>I thought POPC contain deprecated FF similarly I have used same FF for protein in water simlulation also . Whichone I have used deprecated FF for protein in water simulaiton is correct? or Suggest which FF normallly use?<br>
Thanks in advance.<br>