Hi all, <br>I gave 1ns run production step without velocities in md.mdp file, in between my simulation crashed, so I used *tpbconv for continue that crashed run , After finishing that I used *trjcat for catenation of my 2 simulation trajectory files, its shown only 900ps trajectory files into trjout.xtc not 1000ps without error.&nbsp; By using this I plotted  rmsd its shown that only 900ps values graph.<br>
what could be the reason for not getting 1000ps trajectory values, pls give me suggestion,<br>Thanks in advance. <br>