Hello. This is my first time writing an e-mail to this list. So, please apologize if I am doing anything wrong.<br>I have a basic question about gromacs. How do I restrain certain atoms in my protein. I&#39;ve tried to create an ndx file with the residues i would like to restrain and then I created an itp file using posre. But how do I include these restrain forces to my topology file? This path I&#39;ve made, is this correct?<br>
Thank you<br>