I am testing gromacs 3.3 with lam 7.1.1 on a phenom box with fedora core 8 (old code version of gromacs and lam needed to preserve homogeneity with the other older opteron boxes in a pc cluster).&nbsp; gmxtest (for 3.3.2) passes almost all tests when run on 1 to 3 cores (with -np 1-3 option) (failure on dec-wat and fe_test occurs always, even on the older boxes of the cluster). When I try to run the test using all 4 cores ( -np 4 option) a new failure appears on&nbsp; simple/rb1. Here is part of the checkpot.out<br>
<br>(...)<br><br>comparing energy file reference_s.edr and ener.edr<br><br>There are 31 terms in the energy files<br><br>There are 4 terms to compare in the energy files<br><br>Ryckaert-Bell.&nbsp;&nbsp; step&nbsp;&nbsp; 1:&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0.025919,&nbsp; step&nbsp;&nbsp; 1:&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 6.57757<br>
Potential&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; step&nbsp;&nbsp; 1:&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0.025919,&nbsp; step&nbsp;&nbsp; 1:&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 6.57757<br>Ryckaert-Bell.&nbsp;&nbsp; step&nbsp;&nbsp; 2:&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0.0256805,&nbsp; step&nbsp;&nbsp; 2:&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 6.56619<br>Potential&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; step&nbsp;&nbsp; 2:&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0.0256805,&nbsp; step&nbsp;&nbsp; 2:&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 6.56619<br>(...)<br><br>Any idea about the origin of this error? <br>
Thanks<br><br>Gianni