Hi all, <br>Thanks for the response to Mr.Justin and Mr.Chris<br>I calculated&nbsp; the sigma and epsilon values in the way Justin mentioned <br>the values are <br>;name&nbsp;&nbsp;&nbsp; name&nbsp;&nbsp; charge&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; mass&nbsp;&nbsp; charge&nbsp;&nbsp; ptype&nbsp;&nbsp;&nbsp; sigma&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; epsilon<br>
&nbsp; LO&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; LO&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 1 &nbsp; &nbsp; &nbsp;&nbsp; 15.9994&nbsp;&nbsp; 0.000&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; A&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0.295999914&nbsp; 0.878694594 ;carbonyl O, OPLS<br>&nbsp; LOM&nbsp;&nbsp; LOM&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 1&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 15.9994&nbsp;&nbsp; 0.000&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; A&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0.295999914&nbsp; 0.878694594 ;carboxyl O, OPLS<br>&nbsp; LNL&nbsp;&nbsp;&nbsp; LNL&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 1&nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; 14.0067&nbsp;&nbsp; 0.000&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; A&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 3.35300e-03&nbsp; 3.95100e-06 ;Nitrogen, OPLS<br>
&nbsp; <br>Then in First step of procedure, suggested that add atom type H from opls_369 to match H expected by pope.itp<br><br>&nbsp;In archives this type of problem posted for pope type of lipids<br>&nbsp; opls_369 &nbsp; H &nbsp;&nbsp; 1 &nbsp; 1.008&nbsp; 0.400 &nbsp; &nbsp; A &nbsp; &nbsp; 0.0000e+00 &nbsp; 0.0000e+00<br>
&nbsp;Im using POPC type of lipid<br>&nbsp;I want to ask two things<br>1.&nbsp; How can modify H atom type in popc.itp file<br><br>2. Mr. Chris mentioned that Parameters require a double pairs section,&nbsp; how&nbsp; can I mention?<br><br>Pls give me detail explanation <br>
all comments will be appreciated <br>Thanks in advance<br><pre><br></pre>