Dear Experts,<br>Hi, I have done equilibration of a protein but during equilibration due to power supply cut off a crash occurred after which I restarted with the command tpbconv.<br><br>Now I want to start molecular dynamics simulation but confused how&nbsp; to start&nbsp; them.My  files before crash are:<br>Pr.mdp pr.tpr&nbsp; pr .trr pr.edr pr.log<br>while the files generated after crash are:<br>myrestar.edr&nbsp; myrestart.gro&nbsp; myrestart.log&nbsp;&nbsp; restart.tpr<br>&nbsp;while my md input file is md.mdp<br>Please wrote a command in ful from my files so that I can continue my work.<br>Will be thankful for your help.<br>Regards,<br>Lal badshah.<br><BR><BR><STRONG><FONT color=#007f40>SYED LAL BADSHAH <BR>M.Phil Scholar <BR>NCE in Physical Chemistry, <BR>University of Peshawar. <BR>NWFP,Pakistan. <BR>Cell # 03349060632.</FONT></STRONG><p>&#32;Send instant messages to your online friends http://uk.messenger.yahoo.com